Alla caduta dell'Impero Romano d'Occidente Ancona rimane tra i possessi dell'Impero Romano d'Oriente e fece parte della Pentapoli marittima assieme alle citta di Senigallia, Fano, Pesaro e Rimini, per difendersi dal tentativo di conquista dei Visigoti, dei Vandali e dei Goti. Dopo un breve periodo sotto il dominio longobardo, nel 774 d.C. la citta passa allo Stato della Chiesa. Nel saccheggio nel 848 d.C. ad opera dei Saraceni l'arco di Traiano venne spogliato dalle statue e dagli ornamenti.